З 7 по 18 лютого 1906 р. в місті проходив закритий військово-морський суд над першою групою учасників Севастопольського озброєного повстання на чолі с П. П. Шмідтом, матросами-більшовиками С. П. Частником, Н. Р. Антоненко, А. І. Гладковим і іншими. У зв'язку з цим ввели військове положення: місто наповнили війська і козаки, жандарми, був заборонений в'їзд і виїзд. Мужньо, безстрашно трималися на суді лейтенант П. П. Шмідт і його товариші. У своїх промовах П. П. Шмідт викривав царизм, з революційною пристрастю захищав свої погляди, доводив справедливість боротьби за свободу і щастя народу, виражав віру в те, що наступить година звільнення Батьківщини. Останню промову він закінчив словами: «Я знаю, що стовп, у якого встану я прийняти смерть, буде поставлений на межі двох різних історичних епох нашої Батьківщини. Свідомість цю дає багато сили, і я піду до стовпа, як на молитву... Позаду за спиною у мене залишаться народні страждання і потрясіння важких років, а попереду я бачитиму молоду, оновлену щасливу Росію».
18 лютого 1906 р. суд виніс смертний вирок керівникам повсталих моряків: П. П. Шмідту, членам Севастопольської військової організації РСДРП машиністові крейсера «Очаків» А. І. Гладкову, комендорові Н. Р. Антоненко, старшому баталерові С. П. Частнику. Удосвіта 6 березня 1906 р. на острові Березань керівники повстання були розстріляні. У травні 1917 р. останки героїв перезахоронюють в Севастополі. Могила їх знаходиться на кладовищі Комунарів.
Учасником Севастопольського озброєного повстання був і уродженець Очакова матрос 35-го флотського екіпажа Чорноморського флоту І. В. Письменчук. 15 квітня 1906 р. він разом з іншими повстанцями зробив втечу з-під варти, але був арештований в Очакові 22 травня 1906 р. і засуджений до 18 років каторжних робіт.
Криваві репресії властей проти учасників революційних виступів не залякали трудящих. В ході боротьби проти царизму, капіталістів і поміщиків все більш зміцнювався союз робочого класу і селянства. У 1909 р. в Очакові виник соціал-демократичний гурток. Син очаківського рибака столяр М. І. Чижиков був пов'язаний з більшовиками Одеси, звідти привозив прокламації, літературу.
В кінці XIX - початку XX ст. Очаків був звичайним провінційним містечком. Тільки у центральній його частині були споруджені будівлі з каменя або цеглини, криті залізом або черепицею. Тут вулиці і тротуари були замощені, встановлені гасові ліхтарі для нічного освітлення (їх в місті налічувалося близько 50). Трудящі тулилися на околицях в хатинах-мазанках, в яких були відсутні елементарні побутові зручності. Убогість, важкі умови життя, відсутність кваліфікованої медичної допомоги приводили до того, що в місті майже щорічно спалахували епідемії холери, тифу, віспи, дифтерії. Очаківська дільнична лікарня на 17 ліжок з одним лікарем, фельдшером і акушеркою, яка повинна була обслуговувати близько 40 тис. жителів Очакова і довколишніх сіл, не могла запобігти розповсюдженню епідемічних захворювань і надати необхідну допомогу хворим.